El Peugeot 206 Fase 2 (aparecido en la primavera de 2003) es el restyling del utilitario más vendido en la historia de Peugeot. Se distingue por faros de cristal liso, luces traseras rediseñadas, una parrilla de nido de abeja y la adopción generalizada de la red eléctrica multiplexada (CAN/VAN). En el plano mecánico, este período marca el apogeo de las motorizaciones diésel HDi (High Pressure Direct Injection) desarrolladas con Ford, reemplazando definitivamente a los antiguos diésel atmosféricos. Aunque su comportamiento en carretera sigue siendo una referencia, esta generación ha sufrido enfermedades crónicas (eje trasero, electrónica) que requieren una vigilancia particular en el mercado de segunda mano hoy en día.
El Peugeot 206 Fase 2 diésel es un coche con dos caras. Si opta por el 2.0 HDi 90, compra un verdadero tanque capaz de superar los 400.000 km con un mantenimiento básico. El 1.4 HDi 68 es una excelente opción económica para conductores noveles, siempre que se vigilen imperativamente las juntas de los inyectores. Sin embargo, el 1.6 HDi 110 es para evitar en esta generación debido a sus roturas crónicas de turbo. Sea cual sea el modelo, la compra está condicionada por el estado del eje trasero y del COM2000. Es una compra racional si estos puntos ya han sido tratados por el vendedor.